MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae G54 chromosome

Total Repeats: 35754

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011072	GAAA	2	8	199	206	75 %	0 %	25 %	0 %	194398133
2	NC_011072	AAGA	2	8	240	247	75 %	0 %	25 %	0 %	194398133
3	NC_011072	TCA	2	6	291	296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398133
4	NC_011072	GAAATG	2	12	338	349	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	194398133
5	NC_011072	AAC	2	6	360	365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194398133
6	NC_011072	ATT	2	6	374	379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194398133
7	NC_011072	GTA	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398133
8	NC_011072	GAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398133
9	NC_011072	AAAAG	2	10	541	550	80 %	0 %	20 %	0 %	194398133
10	NC_011072	GGA	2	6	659	664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194398133
11	NC_011072	TTA	2	6	686	691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194398133
12	NC_011072	GAAAT	2	10	702	711	60 %	20 %	20 %	0 %	194398133
13	NC_011072	A	6	6	715	720	100 %	0 %	0 %	0 %	194398133
14	NC_011072	AT	3	6	742	747	50 %	50 %	0 %	0 %	194398133
15	NC_011072	TTA	2	6	762	767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194398133
16	NC_011072	GAT	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398133
17	NC_011072	A	7	7	871	877	100 %	0 %	0 %	0 %	194398133
18	NC_011072	GAA	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398133
19	NC_011072	GAG	2	6	983	988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194398133
20	NC_011072	A	8	8	1195	1202	100 %	0 %	0 %	0 %	194398133
21	NC_011072	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398133
22	NC_011072	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194398133
23	NC_011072	GGAA	2	8	1434	1441	50 %	0 %	50 %	0 %	194398133
24	NC_011072	TCAT	2	8	1467	1474	25 %	50 %	0 %	25 %	194398133
25	NC_011072	AAAAT	2	10	1484	1493	80 %	20 %	0 %	0 %	194398133
26	NC_011072	TGAT	2	8	1497	1504	25 %	50 %	25 %	0 %	194398133
27	NC_011072	AATC	2	8	1533	1540	50 %	25 %	0 %	25 %	194398133
28	NC_011072	AAT	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194398133
29	NC_011072	TAA	2	6	1734	1739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194397554
30	NC_011072	ATTT	2	8	1742	1749	25 %	75 %	0 %	0 %	194397554
31	NC_011072	TAC	2	6	1764	1769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397554
32	NC_011072	AG	3	6	1772	1777	50 %	0 %	50 %	0 %	194397554
33	NC_011072	A	7	7	1895	1901	100 %	0 %	0 %	0 %	194397554
34	NC_011072	CTT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194397554
35	NC_011072	CTT	2	6	1942	1947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194397554
36	NC_011072	CTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194397554
37	NC_011072	GTA	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397554
38	NC_011072	AGCA	2	8	2106	2113	50 %	0 %	25 %	25 %	194397554
39	NC_011072	ATT	2	6	2149	2154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194397554
40	NC_011072	TGC	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194397554
41	NC_011072	AG	3	6	2184	2189	50 %	0 %	50 %	0 %	194397554
42	NC_011072	A	6	6	2278	2283	100 %	0 %	0 %	0 %	194397554
43	NC_011072	A	7	7	2294	2300	100 %	0 %	0 %	0 %	194397554
44	NC_011072	TGA	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397554
45	NC_011072	GAT	2	6	2365	2370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397554
46	NC_011072	ACT	2	6	2500	2505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397554
47	NC_011072	GTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194397554
48	NC_011072	GTAAA	2	10	2642	2651	60 %	20 %	20 %	0 %	194397554
49	NC_011072	GAA	2	6	2653	2658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397554
50	NC_011072	ACTT	2	8	2710	2717	25 %	50 %	0 %	25 %	194397554
51	NC_011072	GATT	2	8	2718	2725	25 %	50 %	25 %	0 %	194397554
52	NC_011072	CAG	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194397554
53	NC_011072	TTG	2	6	2937	2942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194396943
54	NC_011072	A	6	6	2948	2953	100 %	0 %	0 %	0 %	194396943
55	NC_011072	AAAAT	2	10	3029	3038	80 %	20 %	0 %	0 %	194396943
56	NC_011072	TGT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194396943
57	NC_011072	ATG	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194396943
58	NC_011072	ATT	2	6	3101	3106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194396943
59	NC_011072	CAG	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194398291
60	NC_011072	GCA	2	6	3280	3285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194398291
61	NC_011072	TGG	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194398291
62	NC_011072	AACT	2	8	3353	3360	50 %	25 %	0 %	25 %	194398291
63	NC_011072	TGA	3	9	3516	3524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398291
64	NC_011072	AATT	2	8	3599	3606	50 %	50 %	0 %	0 %	194398291
65	NC_011072	TTC	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194398291
66	NC_011072	AGA	2	6	3726	3731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398291
67	NC_011072	GAC	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194398291
68	NC_011072	CAAA	2	8	3876	3883	75 %	0 %	0 %	25 %	194398291
69	NC_011072	AGT	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398291
70	NC_011072	GAA	2	6	3943	3948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398291
71	NC_011072	GAT	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398291
72	NC_011072	A	6	6	3973	3978	100 %	0 %	0 %	0 %	194398291
73	NC_011072	CTTG	2	8	4044	4051	0 %	50 %	25 %	25 %	194398291
74	NC_011072	ACTT	2	8	4060	4067	25 %	50 %	0 %	25 %	194398291
75	NC_011072	AAG	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398291
76	NC_011072	AGC	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194398291
77	NC_011072	TAT	2	6	4137	4142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194398291
78	NC_011072	AAG	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398291
79	NC_011072	GAA	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398291
80	NC_011072	AT	3	6	4263	4268	50 %	50 %	0 %	0 %	194398291
81	NC_011072	AAAT	2	8	4376	4383	75 %	25 %	0 %	0 %	194397946
82	NC_011072	AAACA	2	10	4431	4440	80 %	0 %	0 %	20 %	194397946
83	NC_011072	TTGA	2	8	4457	4464	25 %	50 %	25 %	0 %	194397946
84	NC_011072	GAA	2	6	4474	4479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397946
85	NC_011072	AC	3	6	4496	4501	50 %	0 %	0 %	50 %	194397946
86	NC_011072	A	6	6	4548	4553	100 %	0 %	0 %	0 %	194397946
87	NC_011072	ATGA	2	8	4580	4587	50 %	25 %	25 %	0 %	194397946
88	NC_011072	TTA	2	6	4610	4615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194397946
89	NC_011072	GAT	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397946
90	NC_011072	CAG	2	6	4707	4712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194397946
91	NC_011072	TAT	2	6	4735	4740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194397946
92	NC_011072	ATTGGA	2	12	4778	4789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397946
93	NC_011072	GTT	2	6	4811	4816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194397946
94	NC_011072	CAT	2	6	4817	4822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397946
95	NC_011072	GAT	2	6	4844	4849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397946
96	NC_011072	ACT	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397946
97	NC_011072	TTA	2	6	4961	4966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194397105
98	NC_011072	A	6	6	4994	4999	100 %	0 %	0 %	0 %	194397105
99	NC_011072	CTA	2	6	5055	5060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397105
100	NC_011072	TTGCAA	2	12	5067	5078	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	194397105
101	NC_011072	AGA	2	6	5092	5097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397105
102	NC_011072	GAT	2	6	5198	5203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397105
103	NC_011072	TGG	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194397105
104	NC_011072	A	6	6	5238	5243	100 %	0 %	0 %	0 %	194397105
105	NC_011072	T	6	6	5269	5274	0 %	100 %	0 %	0 %	194397105
106	NC_011072	GCA	2	6	5315	5320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194397105
107	NC_011072	GATT	2	8	5325	5332	25 %	50 %	25 %	0 %	194397105
108	NC_011072	GAA	2	6	5384	5389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397105
109	NC_011072	GAG	2	6	5478	5483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194397105
110	NC_011072	T	6	6	5534	5539	0 %	100 %	0 %	0 %	194397105
111	NC_011072	TGA	2	6	5542	5547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397105
112	NC_011072	GAAA	2	8	5590	5597	75 %	0 %	25 %	0 %	194397105
113	NC_011072	GA	3	6	5641	5646	50 %	0 %	50 %	0 %	194397105
114	NC_011072	AGA	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397105
115	NC_011072	TCA	2	6	5746	5751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397105
116	NC_011072	TGA	2	6	5851	5856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397105
117	NC_011072	TGA	2	6	5868	5873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397105
118	NC_011072	AGA	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397105
119	NC_011072	A	6	6	5984	5989	100 %	0 %	0 %	0 %	194397105
120	NC_011072	TCAAT	2	10	6058	6067	40 %	40 %	0 %	20 %	194397105
121	NC_011072	TTTTC	2	10	6098	6107	0 %	80 %	0 %	20 %	194397105
122	NC_011072	AGA	2	6	6112	6117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397105
123	NC_011072	A	7	7	6131	6137	100 %	0 %	0 %	0 %	194397105
124	NC_011072	ATT	2	6	6149	6154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194397105
125	NC_011072	GGA	2	6	6190	6195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194397105
126	NC_011072	CGT	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194397105
127	NC_011072	ACA	2	6	6373	6378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194397105
128	NC_011072	AG	3	6	6391	6396	50 %	0 %	50 %	0 %	194397105
129	NC_011072	TGT	2	6	6433	6438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194397105
130	NC_011072	CAT	2	6	6440	6445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397105
131	NC_011072	AT	3	6	6580	6585	50 %	50 %	0 %	0 %	194397105
132	NC_011072	TAAAT	2	10	6616	6625	60 %	40 %	0 %	0 %	194397105
133	NC_011072	TGA	2	6	6682	6687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397105
134	NC_011072	ACTCT	2	10	6697	6706	20 %	40 %	0 %	40 %	194397105
135	NC_011072	TGA	4	12	6742	6753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397105
136	NC_011072	TGA	2	6	6766	6771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397105
137	NC_011072	GAT	2	6	6794	6799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397105
138	NC_011072	GTA	2	6	6807	6812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397105
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141	NC_011072	TGT	2	6	7138	7143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194397105
142	NC_011072	TGA	2	6	7161	7166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397105
143	NC_011072	TGA	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397105
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150	NC_011072	GTCG	2	8	7694	7701	0 %	25 %	50 %	25 %	194397105
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268	NC_011072	ATG	2	6	12829	12834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194396790
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270	NC_011072	GTA	2	6	12881	12886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194396790
271	NC_011072	AGC	2	6	12894	12899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194396790
272	NC_011072	AGA	2	6	12906	12911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194396790
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274	NC_011072	GTT	2	6	12973	12978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194396790
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278	NC_011072	A	6	6	13195	13200	100 %	0 %	0 %	0 %	194396790
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